國家重點實驗室
固體表面物理化學國家重點實驗室 近海海洋環境科學國家重點實驗室
細胞應激生物學國家重點實驗室 分子疫苗學與分子診斷學國家重點實驗室
國家工程研究中心
國家傳染病診斷試劑與疫苗工程技術研究中心
國家工程實驗室
醇醚酯化工清潔生產國家工程實驗室
國家地方聯合工程實驗室
天然產物源靶向藥物國家地方聯合工程實驗室
教育部重點實驗室
譜學分析與儀器教育部重點實驗室 水聲通信與海洋信息技術教育部重點實驗室
濱海濕地生態系統教育部重點實驗室 高性能陶瓷纖維教育部重點實驗室
計量經濟學教育部重點實驗室(廈門大學)
教育部批準設立的研究機構
廈門大學歷史研究所 廈門大學人類學研究所
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廈門大學經濟研究所 廈門大學宏觀經濟研究中心
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(中國)廈門大學馬來西亞研究所 廈門大學高等教育科學研究所
廈門大學高等教育發展研究中心 廈門大學臺灣研究中心
微納光電子材料與器件教育部工程研究中心 電化學技術教育部工程研究中心
教育部物理化學研究所 教育部寄生動物學研究室(廈門大學)
教育部細胞生物學研究室(廈門大學) 廈門大學亞熱帶海洋研究所
中國海關史研究中心 國家農村社會保險研究中心(勞動與社會保障部委托)
分子診斷教育部工程研究中心
福建省批準設立的研究機構
福建經濟研究中心(省校共建) 福建女性發展研究中心(省校共建)
福建省等離子體與磁共振研究重點實驗室 福建省半導體材料及應用重點實驗室
福建省高校微納米系統重點實驗室 福建省半導體照明工程技術研究中心
福建省高校化石能源化學與化工重點實驗室 福建省化學生物學重點實驗室
廈門大學集成電路設計工程技術研究中心 福建省高校無機化學與功能材料重點實驗室
福建省高校特種陶瓷重點實驗室 福建省特種先進材料重點實驗室
福建省醫學分子病毒研究中心 福建省藥物工程實驗室
福建省高校生物醫學工程重點實驗室 福建省亞熱帶濕地生態學重點實驗室
福建省資源微生物重點實驗室 福建省神經退行性疾病及衰老研究重點實驗室
福建省眼科與視覺科學重點實驗室 福建省基礎醫學實驗教學示范中心
福建省抗癌研究中心 福建省海陸界面生態環境重點實驗室
福建省藥學實驗教學示范中心 福建省濱海濕地保護與生態恢復工程技術研究中心
福建省防火阻燃材料重點實驗室 福建省固體表面涂層材料技術開發基地
福建省陶瓷纖維工程技術研究中心 福建省仿腦智能系統重點實驗室
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廈門市手性藥物重點實驗室 廈門市電子陶瓷材料與元器件重點實驗室
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